航空交通工程服務部負責設計、規劃、統籌、提供、驗收、優化和保養航空交通管制（空管）系統與通訊、導航及監察設施。
民航處的空管系統一直全日24小時運作，暢順可靠，為在香港飛行情報區內飛行的航機提供空中交通服務。由民航處電子工程師、系統承辦商和民航處維修服務承辦商組成的航空交通管理系統（航管系統）技術小組，持續監察系統的軟件更新和微調等工作，以確保作為空管系統核心的航管系統運作穩定。
民航處將繼續確保空管系統的運作暢順可靠，並時刻準備就緒，以應付疫情過後航空交通復蘇和增長所帶來的航班流量。
由民航處電子工程師和飛行程序設計人員組成的代表團，透過視像形式出席國際民航組織亞太陸基增強系統及星基增強系統實施工作小組於二零二一年九月二十七及二十八日舉行的第三次會議，跟與會者分享本處的經驗，包括與國際民航組織亞太區辦公室為陸基增強系統甚高頻數據廣播協調編配頻率，以及在香港國際機場成功試驗陸基增強系統所採納的安全與風險評估程序，以促進亞太地區實施陸基增強系統及星基增強系統。
二零二一年十月十八至二十二日，民航處副處長(1)胡志光率領代表團，以分組主席身分主持利用視像形式舉行國際民航組織亞太地區空中航行規劃和實施小組轄下通訊、導航及監察分組第二十五次會議，並蟬聯分組主席。
通訊、導航及監察分組旨在促進各成員應用先進通訊、導航及監察技術，以協調方式提供無縫空中航行服務，並研訂未來發展方向。是次會議檢視分組在上次會議後的工作和成果，以及轄下工作小組的進展。由電子工程師和空管人員組成的民航處代表團在會議上分享了多項工作的經驗，包括試用無人機為外站設施進行檢查、應用為香港國際機場三跑道系統而設的新通訊、導航及監察儀器保護平面，以及更新亞太區飛行校驗指導文件。
民航處根據國際民航組織的航空系統組塊升級框架，並依照全球空中航行計劃和亞太地區無縫空中航行服務計劃所訂定的優先次序，繼續透過航空系統組塊升級策劃與實施委員會，與航空業界的持份者協力制定策略，在香港分階段實施各個組塊升級項目，並審視最新的實施情況，包括疫情對業界的影響，以督導相關項目在香港的規劃和實施工作。
本部一向重視航空交通工程服務的安全。為進一步優化與維修服務承辦商在安全管理事宜上的溝通與合作，本部於二零二一年成立了民航處暨維修服務承辦商的專責安全管理系統檢討會議，以加強溝通並密切監察維修服務承辦商的安全表現。
除了審察通訊、導航及監察設備的安全績效指標和安全績效目標外，本部亦藉定期安全審計、工作坊及培訓為各個操作與維修保養及項目工程提供支援，以維持良好的安全表現。
為確保本處處理網絡安全事故的能力與時並進，本部主動邀請香港警務處網絡安全及科技罪案調查科於二零二一年四月在民航處總部舉行聯合演集，以加強雙方的協調及應變能力。
此外，本部人員代表民航處出席於二零二一年六月十四日舉辦的國際民航組織亞太地區網絡安全網上研討會，並分享民航處如何保障數碼化空中交通服務免受網絡威脅的經驗。
民航處透過制定一系列網絡保安策略，包括構建新技術、加強保安控制、進行網絡安全評估、與持份者進行演練，以及提升員工的網絡安全意識，務求達致零網絡安全事故。二零二一年十二月，民航處於「網絡安全精英嘉許計劃2021」獲頒政府部門與公營機構界別管理人員獎項，以嘉許民航處在網絡安全方面的專業工作。
根據國際民航組織的要求，香港國際機場的導航儀器每年須進行兩次定期飛行校驗。為盡量減低對香港國際機場和空管運作可能造成的影響，有關校驗通常安排在五月和十一月非流量高峰期進行，並必須在清晨時分，即航班流量增加前開始。
儘管受疫情影響，本部順利協調各持份者，包括國家民航局飛行校驗中心、香港機場管理局（機管局）及香港商用航空中心，於二零二二年三至四月為香港國際機場第三跑道進行啓用前飛行校驗，並取得圓滿成果。
為遵行國際民航組織的全球空中航行計劃，民航處已制定實施計劃，循序漸進地試驗和實施多項應用於衞星通訊、導航及監察／航管系統和服務的新科技。當中，飛前放行指示雙向數據鏈路系統、電子飛行進程單系統、抵港航機排序系統及航空交通服務設施間數據通訊等自全面啓用以來，成效理想，與航管系統順利融合。其他新科技及系統的最新發展概述如下：
現有的先進場面活動引導和控制系統一直有效加強監察航機和車輛在機場的移動情況，並提供安全告警功能。為提升效能，本處引進一套系統恢復能力更強並配備更多傳感器的新先進場面活動引導和控制系統，將監察範圍擴大至第三跑道。新系統的第一期項目計劃於二零二二年投入運作。
新地面監察雷達已安裝於分布機場不同位置的新結構塔頂部，以監察跑道和滑行道上的航機和車輛情況。新地面監察雷達為先進場面活動引導和控制系統提供監察資訊，讓空管主任全天候維持地面交通暢順。
隨着陸基廣播式自動相關監察系統投入服務，空管服務的安全表現和操作效率得以提升。民航處於二零二一年更成功將星基廣播式自動相關監察的數據融入空管系統，此舉不單增強了遠程航空交通監察能力，亦有助提供航空交通流量管理服務。
陸基增強系統利用全球導航衞星系統，為設有適當裝備的飛機提供進場路徑數據、修正指示和完整信息，以支援航機精確進近和着陸。借鏡在機場試行的成功經驗，本部正擬訂陸基增強系統的技術要求和審視飛機的裝備，從而為香港國際機場制定陸基增強着陸系統的實施計劃。
新儀表着陸系統由32元超闊孔徑航向信標天線陣、3元M型下滑道天線系統和雙向測距儀組成，已在第三跑道兩端完成安裝，可為將在跑道上着陸的飛機提供精確的橫向和垂直導引導航訊號。新系統計劃於二零二二年投入服務。
年內，本部完成機場協同決策網關的優化工作，透過提供更全面的航空交通數據，使本處與機管局更有效應對三跑道系統運作所帶來的挑戰。一如以往，民航處會繼續全力支援香港國際機場，並就技術及運作方面提供意見，以提升其整體運作效能。為協助督導區內發展機場協同決策，民航處不遺餘力地參與國際民航組織亞太地區機場協同決策工作組會議，並通過分享香港國際機場的經驗，推動區內機場訂定協同決策的發展藍圖。民航處會繼續積極參與和倡導區內機場在協同決策和航空交通流量管理的融和發展。
數碼指揮塔技術於香港國際機場圓滿完成試驗後，民航處按照最新的國際標準和指引，於二零二一年開始在香港國際機場全面採用數碼指揮塔設施。
數碼指揮塔設施配備超高解像攝影機及影像分析技術，提供機場的實時全景，而當中的航機和車輛影像更可顯示相關的飛行資訊。數碼影像結合人工智能，提供更強的預警功能，例如及早偵測到航機過於接近另一航機或誤進飛行區的限制區域等情況。第一期數碼指揮塔設施計劃於二零二二年投入使用，以進一步提升空管人員的整體效率和對實際情況的警覺性。
為配合三跑道系統的運作，塔台空管人員的培訓需求日增。為此，本部聯同航空交通管理分部於二零二一年十月在民航處總部大樓構建了一座新指揮塔模擬器，並將現有的指揮塔模擬器升級。新指揮塔模擬器採用尖端的投影和影像產生技術，是全球最先進的指揮塔模擬器之一。
國際民航組織倡議各成員國應根據各自的成本效益分析，盡快實施亞太區航空共同虛擬專用網絡。為支持該項倡議，民航處已開始將現有鏈路分階段轉移至該專用網絡，以提升與其他區域空管中心的航空通訊效率。民航處與馬尼拉、福岡和北京的區域空管中心已完成有關工作，把語音或數據鏈路轉移至該專用網絡，至於與曼谷和胡志明的區域空管中心的轉移工作，則計劃於二零二二年進行。
全系統資訊管理是國際民航組織全球空中航行計劃的重要組成部分，涵蓋該計劃內多個航空系統組塊升級項目。全系統資訊管理旨在促進航空業界各持份者使用統一標準的共同平台，互相交換飛行、氣象和航空資訊。
民航處一向十分支持國際民航組織，在亞太地區促進和實施全系統資訊管理。二零二一年，民航處繼續與區內的主要空中航行服務提供者攜手合作，共同籌備採用全系統資訊管理進行航空交通流量管理的運作測試，通過實時交換全系統資訊管理信息來執行航空交通流量管理的運作流程，以展示實施全系統資訊管理的效益。
民航處領導區內主要的空中航行服務提供者及業界伙伴，羣策羣力利用全系統資訊管理共享航空監察數據，以提升空管安全及運作效率。二零二一年，本部帶領國際民航組織亞太地區轄下新成立的專責研究小組，就利用全系統資訊管理共享航空監察數據進行可行性研究、概念驗證及試行，為日後實施有關管理提供參考模型。
民航處自二零一五年起利用能源優化系統為總部大樓的中央空調製冷機組節能。二零二一年，民航處進一步以人工智能演算法優化該系統原先以規則為參考基礎的演算法，包括應用智能神經網絡演算法，根據室外溫度和相對濕度、製冷機組及冷卻塔出入風口的溫度等輸入參數，計算出製冷機組、水泵及冷卻塔的最佳運作參數，提升節能效率。
此外，民航處在總部圖書館安裝了一套智能照明系統，以作小規模應用測試。該系統備有多種調控方式，優化節能效果。測試所得的經驗有助日後在其他場所應用相關科技，節約能源。
民航處總部的停車場管理系統隨總部大樓於二零一二年啓用而開始運作。由於停車場的使用量增加和硬件逐漸老化，民航處於二零二一年九月將系統全面升級並增加多種功能，包括車牌識別及與停車場資料自動配對、實時計算並顯示可用泊車位資訊、為訪客預留泊車位，以及提供停車場使用量的統計數據等，以期為使用停車場的人士提供更佳體驗，同時讓管理人員更有效地分析數據，改善停車場的使用情況。
民航處已分階段展開機場外站的建築物及設施翻新工程，以配合各種空中航行服務設備的更換計劃。年內，民航處已公開招標以委聘顧問，就翻新工程提供詳細設計及工料測量服務，並預計於二零二二年委聘有關顧問。
資訊科技管理小組通過有效落實新資訊科技措施和電子政府策略，持續地支援民航處各分部的日常運作。
民航處於二零二二年年中推出小型無人機電子平台。為確保平台運作暢順，小組率先與航空業界持份者在二零二二年一月展開技術測試。這個專設平台可供市民為無人機註冊和獲取安全資訊，以符合新法例的要求。
在應用大數據分析方面，民航處於二零二一年五月在現有的大數據分析平台上設置航班復飛和升降活動情況的影像分析報告儀表板，亦在二零二二年三月完成航空交通管理影像分析儀表板原型，促進分部同事探索大數據下的隱藏模式，並從中得到啓發而歸納出專業見解。